Годом образования села Поротниково считается 1916 год. Возникло Поротниково на берегу реки Бакчар. Раскорчевал место и построил первый дом в селе беглый солдат Поротников, семья которого жила охотой, рыбалкой, дарами леса, тайги.

В 20-е годы, в период, называемый в истории России: НЭПом, коллективизацией, раскулачиванием, было принято постановление о колхозах и совхозах. В Поротниково было много сослано раскулаченных с Урала, в 30–33 годах — с Алтая, в 36 году приехали ссыльные еврейские семьи. Много было выходцев с юга — грузины, ассирийцы.

Ссыльных стали объединять в колхоз. 1929 год стал для села годом образования хозяйства «Весна». В 28–29 годах были построены барак под больницу на берегу реки Бакчар, семилетняя школа и комендатура. Люди начали строить себе отдельные жилые дома только в 32–34 годах. Раскорчевывали землю под поля, постройки. В 1931 году была построена животноводческая ферма. В 1936 году в Поротниково образованы ясли-сад. Еще перед войной была построена своя пекарня-домик с русской печью, где выпекали хлеб по трудодням. Все обязаны были трудиться, даже дети, чтобы заработать трудодни, а потом на них получить хлеб.

После войны в 1946 году на берегу реки Тетеринки, недалеко от места впадения ее в реку Бакчар, построили плотину, чтоб провести электричество в село. Там же построили мельницу, которая работала на электричестве. Электростанция работала на солярке. Из Томска приезжали электрики, устанавливали оборудование. А в 1952 году за селом построили каменное здание, в котором работающий на солярке движок, снабжал село электроэнергией вплоть до 1973 года. По ночам он отключался, поэтому свет был непостоянно. Только в 1973 году была проведена высоковольтная линия, и эта проблема была разрешена.

В 1953 году к колхозу «Весна» присоединили село Чумакаевка и новое объединение назвали колхозом имени Маленкова. В начале 60-х годов были присоединены поселки Кузнецовка и Полынянка, и колхоз был переименован в «Сибиряк». А в 1971 году его реорганизовали в совхоз «Сибирь».

Со всех окрестных деревень детей свозили в школу в Поротниково. Семилетняя школа просуществовала до 1954 года. В 1954 году был организован 8-й класс, в 1955 — 9-й класс и с 1956 года Поротниковская школа стала средней.

1960 год в истории села Поротниково ознаменовался основанием радиоузла, работавшего от двигателя на топливе, организацией тракторной бригады.

В сфере культуры села можно отметить следующее: в конце 40-х годов построен клуб, где собирались общие собрания, показывались фильмы, с 60-х годов фильмы шли каждый день, было по 2 сеанса — детский и взрослый. К каждому празднику читались лекции, как местными, так и приезжими членами партийной организации.

Через село Поротниково проходит трасса «Бакчар — Томск», которая существует в таком виде с 70-х годов. Первоначально дорога проходила прямо по селу. Через реку Бакчар переправлялись на пароме. Затем к концу 50-х годов река стала мелеть, видимо из-за осушения болот, судоходство прекратилось. Через реку был построен деревянный мост. Когда асфальтировали трассу, мост был возведен железобетонный, который существует до настоящего времени.

В конце 70-х — начале 80-х годов проводимая государством политика переселения на добровольной основе способствовала: прибытию в Поротниково новоселов из Чувашии, постройки большого количества новых домов, зданий, укрупнению хозяйства, увеличению поголовья скота, раскорчевыванию новых полей, разбивки совхозного сада, в котором росли саженцы смородины, малины, жимолости.

К 1976 году были закончено строительство нового медпункта, новой двухэтажной школы. В 1984 году построено новое двухэтажное здание детского сада. 1987 год стал для истории села годом последней крупной стройки: возведением стадиона к районным сельским спортивным играм.

Поротниковский сельский Совет депутатов трудящихся и его исполнительный комитет был организован на базе Тетеренского сельского Совета, который образовался в 1936 году. Документы, подтверждающие образование сельского Совета, не сохранились.

В состав Тетеренского сельского Совета входили следующие поселки: Аганино, Вояновка, Кузнецовка, Лузинка, Н- Макаровка, Ст.-Макаровка, Поротниково, Чумакаевка, Щелкановка. В 1961 году в Тетеринский с/Совет влился п. Первомайск (бывшая Воробьевка). В 1963 году на основании решения райсполкома № 116 от 23 мая Тетеринский сельский Совет депутатов трудящихся был переименован в Поротниковский сельский Совет депутатов трудящихся.

С принятием новой Конституции СССР в 1977 году Поротниковский сельский Совет депутатов трудящихся был переименован в Поротниковский с/Совет народных депутатов. В октябре 1979 года согласно решения райсполкома на основании постановления общего собрания граждан с. Полынянка, учитывая происшедшие изменения в численности населения на территории Полынянского с/Совета, а также социально-экономические перспективы развития села, в Поротниковский с/Совет народных депутатов влился Полынянский с/Совет в составе одного села — Полынянка. Поселок Первомайск передан в состав Бакчарского сельского Совета.

В январе 1992 года Поротниковский с/Совет переименован в Поротниковскую сельскую администрацию.

Поротниковское сельское поселение было образовано в 2006 году в связи с реализацией на территории Бакчарского района Федерального Закона от 06.10.2003 г. № 131-ФЗ «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации». Границы Поротниковского сельского поселения утверждены решением Бакчарского районного Совета депутатов от 19.05.2004 г. № 179 и Законом Томской области от 09.09.2004 г. № 194-ОЗ.